Fruto de tres décadas de investigación, Fidel y la guerra desconocida constituye un excelente cuadro del incipiente enfrentamiento de la Revolución Cubana, contra fuerzas externas --desde la conspiración trujillista y la mafia organizada norteamericana, hasta la Agencia Central de Inteligencia--;que apoyaron el alzamiento de bandas armadas contrarrevolucionarias en diferentes zonas del territorio cubano.